Microbiota ¿Cómo funcionan las pruebas?

Estamos completando una serie de artículos sobre microbiota. El primero fue sobre cómo funciona la microbiota y el último , sobre el efecto de las drogas en las bacterias intestinales. En este artículo le diremos cómo se realiza la prueba de "Microbiota Genetics" de Atlas, por qué necesita una muestra de silla y también qué recibirá el usuario en función de los resultados de la prueba. ¡Para nuestros leales lectores, hemos preparado un regalo al final del artículo!


Ilustración de Rentonorama.

Descargo de responsabilidad! La prueba "Genética de la microbiota" no es diagnóstica y está diseñada para adultos sanos que desean aprender más sobre la condición de sus intestinos. Si tiene síntomas y está preocupado por su salud, consulte a su médico.

¿Por qué caca?


La microbiota intestinal en todo el mundo ahora está aislada de una muestra de heces. Es simple, seguro y barato. El análisis de la microbiota en este caso es preciso: podemos medir la proporción de familias y géneros bacterianos. Sin embargo, la imagen será característica únicamente del colon.

Estudiar las bacterias del intestino delgado es difícil. Incluso para el diagnóstico de enfermedades, como el síndrome de sobrecrecimiento bacteriano, se utilizan pruebas de aliento no invasivas. Por lo tanto, todos los datos sobre la microbiota, de hecho, sobre las bacterias del intestino grueso.

La caja para recoger biomaterial contiene un tubo de ensayo, una capa superpuesta para el inodoro, una espátula, una báscula Bristol e instrucciones. Una superposición especial le permite evitar el contacto de la muestra con el inodoro, lo que hace que el análisis sea más preciso.

Diferentes compañías usan diferentes superposiciones. Por ejemplo, el Proyecto del microbioma humano brinda a los usuarios recipientes de plástico en los que la muestra se empaca inmediatamente. Consideramos que la versión en papel es más ecológica, segura y económica.

Use una espátula para transferir aproximadamente un guisante de material a un tubo de ensayo. Después de eso, debe cerrarlo y agitarlo bien. Dentro del tubo de ensayo hay una solución: es un estabilizador de ADN que evita que el material genético de las bacterias se deteriore antes del laboratorio. Utilizamos un conservante bactericida que mata las bacterias pero deja todo el ADN.

Para que los resultados de la prueba sean más precisos, le pedimos al usuario que evalúe su muestra de heces en la escala de Bristol. Tiene en cuenta la forma y la consistencia, lo que finalmente afecta el resultado. Los estudios muestran que cuanto más dura es la muestra, más diverso es el microbioma humano. Y las heces sueltas a menudo se asocian con bacterias escasas.

¿Cómo es la secuenciación?


Los fragmentos de ADN que pertenecen a un gen 16S rRNA específico se aíslan de una muestra de heces en el laboratorio. RRNA es ARN ribosómico, y estamos estudiando un gen que contiene información al respecto.

Este gen es uno de los principales factores en la clasificación de bacterias y arqueas: por su secuencia determinamos quién pertenece a qué género y familia, qué tan cerca están las bacterias entre sí.

El gen 16S rRNA es único porque combina regiones conservadoras y variables que le permiten determinar la genealogía de las bacterias (taxonomía). Leemos la secuencia de nucleótidos de cada fragmento y descubrimos a qué género y familia pertenece la bacteria. Esto se puede comparar con la determinación de la región por número de automóvil. Cuantos más fragmentos idénticos de 16S rRNA estén en la muestra, mayor será la proporción de ciertas bacterias a las que pertenece.



Como resultado, obtenemos una composición porcentual con una participación para cada tipo de microbios. Y la función de la microbiota depende del número de tipos de microorganismos. Por ejemplo, si tiene muchas bacterias que producen ácido butírico, significa que su microbiota hace un buen trabajo al respecto.

Cada perfil de microbiota se compara con los promedios de población de la base, que recopilamos sobre la base del trabajo científico y gracias a los participantes en la campaña de crowdfunding. Entonces analizamos cómo su microbiota difiere de la composición de bacterias en una población sana.

¿Qué obtendré?


Por la composición de las bacterias intestinales, es posible determinar cómo la microbiota hace frente al procesamiento de la fibra, la síntesis de ácido butírico, la producción de vitaminas, así como qué tan diversa y similar a la microbiota de las personas con enfermedades.

Variedad


Esta es la primera señal que se presenta a un usuario de prueba. La diversidad de la microbiota determina cuán estable es la comunidad bacteriana y qué tan bien protege contra los microorganismos patógenos. Cuantas más bacterias diferentes vivan en los intestinos, mejor se sentirá una persona y menor será el riesgo de desarrollar inflamación. Esto ha sido probado en varios estudios.

Desafortunadamente, es difícil comenzar un nuevo tipo de microorganismo que no está en los resultados. Ocurre que debido a las recomendaciones, esas bacterias crecen que inicialmente se presentan por debajo de nuestro umbral (0.02%). Sin embargo, esta es más bien la excepción.

Procesamiento de fibra y síntesis de ácido butírico


Ya escribimos que la fibra en la dieta reduce los riesgos de enfermedad y mortalidad por cualquier causa. Sin embargo, si la proporción de bacterias que procesan la fibra es pequeña, la ingesta de fibra puede ser menos efectiva. En este caso, hacemos una lista de productos cuyo consumo aumenta la proporción de tales bacterias.

La síntesis del ácido butírico depende de qué tan eficientemente los microorganismos procesen la fibra. Se alimenta de colonocitos - células epiteliales intestinales. Cuando este ácido no es suficiente, las células se enfrentan peor a los microorganismos patógenos y los intestinos son más propensos a la inflamación.

Analizamos cuántas bacterias productoras de ácido butírico hay en la microbiota, y en base a esto damos una estimación. Si estos microorganismos son pocos, aparecerá una lista recomendada de productos para mejorar la situación en la sección.

Bacterias probióticas


Se sabe que algunos tipos de bacterias aportan grandes beneficios a los humanos. Ayudan a las células intestinales a regular la inmunidad, proteger contra la obesidad, producir ácido butírico y otros metabolitos importantes.

Analizamos la proporción de tales microorganismos y recopilamos datos en un bloque separado. Allí puede obtener más información sobre cada bacteria probiótica, qué funciones realiza y cuánto suele hacer en una población sana.



Puede aumentar la proporción de estas bacterias si están en la microbiota. Es suficiente usar productos lácteos fermentados con bacterias vivas, chucrut, kombucha (Kombucha), productos con los tipos de fibra en los que crecen estos microorganismos o aditivos probióticos especiales.

En cuanto a la ingesta de suplementos, es mejor consultar primero con un especialista. Curiosamente, las bacterias probióticas son beneficiosas, incluso si no están en la microbiota humana y simplemente pasan a través del tracto gastrointestinal.

Protección contra enfermedades


Hasta ahora, no se sabe cómo las bacterias afectan el desarrollo de enfermedades y cómo interactúan con las drogas. Sin embargo, existe evidencia de que la composición de las bacterias intestinales en personas con enfermedades es muy diferente. En nuestros artículos anteriores, hemos explicado en detalle lo que se sabe sobre esto en este momento.

En el estudio, comparamos su microbiota con la microbiota característica de una persona con una enfermedad, y evaluamos cuán diferentes son los perfiles. Si su microbiota es completamente diferente a la microbiota del paciente, tiene suerte, lo más probable es que su riesgo sea menor. Y si los perfiles son similares, debe prestar atención a la salud del cuerpo y al estado de las bacterias intestinales.


Lista de todas las enfermedades en su cuenta.

Vitaminas


La composición de la microbiota determina qué tan bien las bacterias producen vitaminas. Básicamente, sintetizan vitaminas K y B. Esto puede afectar el nivel general de vitaminas en el cuerpo. El problema es que no podemos medir qué tan bien los intestinos absorben estos nutrientes. Además, cuantas más vitaminas sintetiza la microbiota, mayor es la probabilidad de que sean absorbidas y respalden el nivel general normal de oligoelementos.

Enterotipos


Dependiendo de qué familia y género de bacterias domina en la microbiota, todos los perfiles se pueden dividir condicionalmente en tres tipos. También se llaman enterotipos.

En la microbiota de los amantes de la dieta occidental, a menudo prevalecen las bacterias del género Bacteroides. En nuestra prueba, este tipo se llama "Residente de una gran ciudad". Aquellos a quienes les gustan los cereales y los alimentos con almidón generalmente tienen una mayor proporción de la familia Firmicutes y ácido butírico productor de bacterias. A los representantes de este tipo los llamamos "campesinos del pueblo". Entre los amantes de las verduras, frutas y dulces, el género Prevotella a menudo domina. Por lo general, este tipo es más común entre los pueblos tribales, por lo que en nuestra prueba se llama "Habitante de la selva".

Depende del enterotipo qué tan bien las bacterias lidian con el procesamiento de la fibra, la síntesis de ácido butírico y vitaminas. A veces una persona puede tener un tipo mixto de microbiota. En este caso, las zonas de proyección de las bacterias características de cada tipo se superponen entre sí. Pero un enterotipo seguirá dominando (el de la capa superior en el gráfico).



Recomendaciones nutricionales


Cada signo tiene una escala que se divide en tres colores: rojo, amarillo y verde. El verde significa que todo está bien contigo, el amarillo está dentro de los límites normales y el rojo es una señal de un cambio en el estilo de vida. Cada elemento problemático tiene listas de productos recomendados. La única excepción es el signo de la diversidad, sobre el que escribimos anteriormente.

Las listas de productos se basan en bacterias intestinales. Analizamos qué bacterias en la microbiota son pocas, qué tipo de fibra les gusta y también dónde están contenidas estas fibras. Resulta una lista que puede aumentar la proporción de bacterias necesarias.

Analizar constantemente diferentes listas y elegir productos para la canasta de comestibles requiere mucho tiempo y atención. Por lo tanto, creamos un algoritmo que selecciona varios atributos por semana, analiza las listas de productos recomendados y compila el TOP-10.

Se muestra en la página principal de nuestra aplicación iOS y en su cuenta, su tarea es incluir estos productos en su dieta esta semana. Luego se actualizará la lista: tendrá otras características y productos.



Entonces que


La microbiota se actualiza constantemente según la dieta. Cuando comes más carne y dulces, las bacterias que descomponen la fibra son pocas. La microbiota hace frente a los microorganismos patógenos peor, aumenta el riesgo de inflamación. Cuando incluye muchas verduras, cereales y frutas en su dieta, aumenta la proporción de bacterias beneficiosas. Por lo tanto, la microbiota debe ser monitoreada constantemente.

Recomendamos repetir el análisis de microbiota tres meses después del primer examen. Durante este tiempo, si sigue las recomendaciones, los cambios serán más significativos y el hábito de incluir productos de la lista en la dieta tendrá tiempo para establecerse. Para que pueda seguir los cambios relacionados con la nutrición y ajustar la dieta en la dirección correcta.

La prueba "Genética de la microbiota" cuesta 14.900 rublos, pero para nuestros lectores en Habré hemos preparado un descuento. Use el código promocional HABRBIOME y solicite una prueba por $ 159. Entrega en toda Rusia.

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Source: https://habr.com/ru/post/456596/


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