نتائج OhmyGut المرحلة الأولى

لقد تحدث أطلس بالفعل عن مشروع بحثنا عن البكتيريا المعوية في OhmyGut. في يناير ، أطلقنا التمويل الجماعي على Boomstarter لبدء البحث حول الكائنات الحية الدقيقة من السكان الروس. كانت هذه هي الحالة الأولى في روسيا في البحث عن التمويل العام لمشروع التكنولوجيا الحيوية - وتبين أنها ناجحة.

بعد الانتهاء من الحملة على Boomstarter ، قمنا بتسليم مجموعتين من اختبارات OhmyGut إلى جميع المشاركين. كانت الفكرة هي: الجميع يجتاز التحليل الأول ، ثم يجرون الاستبيان ، ويحصلون على توصيات التغذية ، ويتابعونها لمدة أسبوعين ويجتازون الاختبار مرة أخرى. ونتيجة لذلك ، نحصل على 271 × 2 أنبوبًا وكمية ضخمة من المواد لاختبار الفرضيات العلمية والتسويقية.

هكذا حدث كل شيء ، والآن سنشارك النتائج.





قالوا لي كلمة ، نشرتها في سطر


لتحديد الأنواع الميكروبية وبأي نسب تعيش في الأمعاء ، يتم استخدام تسلسل metagenomic. تقرأ هذه التقنية التسلسل الجينومي للميكروبات "كما هي" ، دون أن تنقسم أولاً إلى مجموعات وتنمو مستعمرات في أطباق بتري.

استخدمنا الطريقة الأبسط والأرخص: لم نقرأ جميع الجينومات بالكامل ، ولكن جين واحد فقط من كل ميكروب يبلغ طوله عدة مئات من الأحرف - وهي 16S rRNA. تستخدم الخلية هذا التسلسل لبناء الريبوسوم ، أهم آلة جزيئية ضرورية لتكوين البروتين.

تسلسل الجينات 16S rRNA فريد لكل نوع. لذلك ، فهي رائعة لتكوين البكتيريا الجينية. تتم قراءة التسلسل باستخدام أجهزة التسلسل (أغلى المعدات في العملية برمتها). يتم إدخال الحمض النووي المستخرج من عينات الكائنات الحية الدقيقة إلى المدخلات ، ويتم الحصول على البيانات عند الإخراج: آلاف القراءات لكل عينة. في دراستنا ، كان متوسط ​​القراءة يزن حوالي 250 حرفًا.

هذا ما تبدو عليه قراءة جينوم Escherichia coli Escherichia coli : أصبح



تحديد أنواع البكتيريا أو جنسها أو عائلتها بهذه الكلمة ممكنًا بفضل عدد من الدراسات الجينومية للبكتيريا. يتم تجميع جميع البيانات والمنشورات العلمية في قاعدة بيانات NCBI العامة المشتركة .

بشكل عام ، فإن طرق دراسة التركيب البكتيري تشبه تلك التي نستخدمها للاختبار الجيني. في المختبر ، نقوم بعزل الحمض النووي لمنطقة جينوم واحد (16S rRNA في حالة الكائنات الحية الدقيقة) باستخدام بادئات خاصة ، ثم نضرب الجزيئات التي تم الحصول عليها بمساعدة بروتين بوليميراز ، ونقرأها ، ونقرأها ونحدد أي البكتيريا وما هي النسب الموجودة في العينة. نقوم بتحليل البيانات التي تم الحصول عليها ، وتجميع تقرير وتوصيات بناءً على النتائج ، وتحميلها على حسابك الشخصي. # كل سعيد.

في روسيا ، لا يقدم أي شخص آخر مثل هذه الدراسات لمجموعة واسعة من المستخدمين. في الولايات المتحدة الأمريكية ، منذ بضع سنوات ، تم إطلاق مشروع uBiome ، الذي يجري اختبارات الميكروبات (وليس فقط الأمعاء). يعمل مشروع بحث الميكروبات الخاص بي في ألمانيالكن حتى الآن هذا ليس منتجًا تجاريًا ، وتكلف المشاركة فيه حوالي 600 يورو. لا يوجد لدى OhmyGut منافسين أقرب إليهم.

تمثيل عينة والتحكم


لم يكن التمويل الجماعي اختبارًا تجريبيًا لـ OhmyGut كمنتج تجاري مستقبلي فحسب ، بل كان أيضًا بحثًا علميًا. ومع ذلك ، لم يكن هناك مجموعة تحكم فيها: لم نطرح أي فرضيات لاختبار تصميم "التحكم في التجربة" الذي قد يكون مطلوبًا.

إن عينة "المشاركين في التمويل الجماعي على Boomstarter" غير تمثيلية - بمعنى استخدام هذا المفهوم في علم الأوبئة. لدراستنا ، لم نختار مثل هؤلاء سكان موسكو الذين سيعكسون إحصاءات لموسكو. على الرغم من أن جميع الأنماط المعوية الرئيسية الثلاثة ممثلة في عينتنا ، لا يمكننا القول أن نسبة هذه الأنواع ستكون هي نفسها في عينة تمثيلية من موسكو أو روسيا. لكن "غير تمثيلي" لا يعني "غير علمي".
ما هو مثل هذا النموذج المعوي
— , , .

أجرينا دراسة تدخل مستقبلية ، حيث كانت التوصيات الغذائية التي قدمناها للمشاركين بعد ملء الاستبيان تدخلات. وفقًا لنتائج دراستنا ، قمنا بتقييم تأثير العوامل المختلفة على تكوين الكائنات الحية الدقيقة ، بالإضافة إلى نطاق تغييرات الكائنات الحية الدقيقة لأولئك الذين تغيروا ولم يغيروا عاداتهم الغذائية.

مثال على دراسة ذات تصميم مماثل هو المشروع ، الذي نظر في مجموعتين بشكل منفصل: النباتيين الذين بدأوا في تناول اللحوم ، وأكل اللحوم الذين توقفوا عن تناول اللحوم وأكلوا الأطعمة النباتية.

من هم أعضاء OhmyGut للتمويل الجماعي؟


في المجموع ، شارك 271 شخصًا في الدراسة ، وجميعهم من سكان موسكو. إذا كنت تصف متوسط ​​المشارك في مشروع OhmyGut ، فسيكون هذا شابًا (29-31 عامًا) من اللياقة البدنية الطبيعية (مؤشر كتلة الجسم 21-23 مع معيار 19-25) ، يأكل أربع مرات في اليوم وينام 7-8 ساعات. يذهب للرياضات عدة مرات في الأسبوع (ويفضل أحمال القلب على تدريب القوة) ولا يشرب الكثير - فقط كوب من النبيذ الجاف عدة مرات في الشهر. ربما نتعرف على أنفسنا أو على أصدقائنا في هذه الصورة.

وماذا يأكلون


النظام الغذائي للمشارك العادي في اختبار OhmyGut قياسي تمامًا: اللحوم ومنتجات الألبان ومنتجات الألبان والبطاطس والخبز الأبيض عدة مرات في الأسبوع ولا يوجد زيت بذور الكتان والكينوا (حتى نتلقى توصياتنا). في كلمة واحدة ، لا شيء لم نكن نعرفه عن أنفسنا.

استنادًا إلى نتائج الاستبيان ، قمنا بتجميع رسم بياني وإنشاء روابط بين المنتجات التي تعد جزءًا من النظام الغذائي الطبيعي للمشاركين. كان من المثير للاهتمام اختبار النموذج الرياضي بملاحظات من الحياة. المشاركون في الدراسة يأكلون الطماطم مع الخيار فقط ؛ إذا كان هناك لحم في النظام الغذائي ، أي الدواجن ، يتم إقران الكوسا مع الباذنجان والقرنبيط - مع القرنبيط. على الرسم البياني ، يمكنك أن ترى كيف تم تجميع المنتجات في نوعين: نباتي بشروط (الزاوية اليمنى العليا) وتناول اللحوم بشروط (أسفل اليسار).



ماذا حدث


لقد قمنا بتجميع قاعدة بيانات لتكوين الكائنات الحية الدقيقة والبيانات الوصفية للمستخدم وتقرير للمشاركين في أكثر من 90 صفحة. يحتوي على عدة أقسام: تكوين البكتيريا ، ووصف لأنواع الكائنات الحية الدقيقة ، ومستوى الحماية ضد الأمراض ، وتوليد الفيتامينات ، وتوليف حمض الزبدة الزبدية ، وتوصيات للمنتجات والبريبايوتكس.







بفضل توصياتنا ، تمكن بعض المشاركين من زيادة تمثيل البكتيريا المفيدة ، وجعل الكائنات الحية الدقيقة أكثر توازناً ، وحتى تغيير مجموعة واحدة من الكائنات الحية الدقيقة إلى أخرى. على سبيل المثال ، من النوع الثالث مع النظام الغذائي "الغربي" السائد والوجبات السريعة - في الثانية ، أكثر نباتية.

حسنًا ، أهم نجاح هو التأكيد على أن الشخص السليم العادي مستعد لاجتياز هذا الاختبار. حتى مرتين. فقط لتناول الطعام بشكل أفضل. مثير للإعجاب!

ما لم ينجح


سنواصل العمل في قسم التوصيات. الآن نقدم قائمة بالمنتجات الإضافية المفيدة للبكتيريا الجيدة والتي ستزيد من تمثيلها. يشمل ، على سبيل المثال ، الخرشوف الهندباء والقدس - وما زلنا نزيل أوراق الموز من النص (ملاحظة للمضيف: إنها مفيدة).

في الوقت نفسه ، من الخطأ الحفاظ على مستعمرات البكتيريا المعوية حصريًا وفي نفس الوقت ترك جسم الإنسان نفسه بدون مغذيات أساسية. أخذنا في الاعتبار هذا الفارق الدقيق ونخطط لإشارة إلى أساسيات التغذية السليمة في التكرار التالي للتقرير.

ماذا الآن


علينا فقط أن نشكر جميع المشاركين في التمويل الجماعي ونعود إلى العمل. قبل الإصدار الثاني من التقرير ، تم تصحيحه واستكماله ، الإطلاق التجاري للاختبار والتكامل مع بيانات الاختبار الجيني. في هذه الأثناء ، يمكنك أن تأخذ نفسا والحصول على بعض المتعة .

Source: https://habr.com/ru/post/ar395021/


All Articles