تصور شجرة الرئيسيات

نشر ستانيسلاف دروبيشيفسكي في بداية العام شجرة تفصيلية لأصل الرئيسيات . نسخة PDF

طلب المعلقون على فكونتاكتي نسخة تفاعلية ( 1 ، 2 ، 3 ، 4 ) ، لأنه أكثر ملاءمة للتعلم وأسهل في التحديث عند ظهور بيانات جديدة.

قررت أنا وأليا Mokhova المساعدة في علم أمراض البدلات القديمة وقمنا بعمل نموذج أولي على d3js.

على اليسار هو الرسم البياني الأصلي ، على اليمين هو نسختنا:

موقع المشروع

سأخبرك كيف سار العمل وما التقنيات التي ساعدتنا.

الغرض

نريد أولاً إنشاء مخطط علمي شائع ، نسخة أكثر تقدمًا للصورة الشهيرة:

ولكن حول هذا هناك بالفعل مشروع ممتاز من قبل جليب كراوكليش .

قررنا الذهاب في الاتجاه الآخر: إنشاء نظام نموذجي لتجميع البيانات الأثرية. بالطبع ، أود أن أقوم بعمل مشروع ضخم مع حركة الصفائح التكتونية ، صور الاكتشافات ، معلومات تفصيلية عن كل صنف ، روابط إلى ويكيبيديا ، ورسم بياني لمتوسط ​​درجة الحرارة السنوية. لكننا قررنا البدء بعمل نسخة تفاعلية من المخطط الحالي.

تصميم

في الدائرة الأصلية ، لا يتم استخدام اللون تقريبًا. يمكنك إظهار اللون ، على سبيل المثال ، في أي قارة تم العثور على الوحش.

أريد أيضًا أن أبين بوضوح أكثر التسلسل الهرمي للتصنيفات (مجموعات الكائنات الحية).

أقوم بعمل الرسم الأول:

تثار الأسئلة على الفور. على سبيل المثال: "هل يجب أن تعتمد الروابط الأسرية بطريقة ما على تعشيش الأصناف؟" علينا أن نتعمق في ويكيبيديا ، نتعرف على العادات و monophilia . أتعلم من ستانيسلاف أنه لا يوجد رسم تخطيطي في الرسم التخطيطي ، مما يعني أن شجرة الروابط الأسرية لا يجب أن تتطابق مع حاوية الأصناف.

أرسم قطعة من الدائرة ببيانات مشابهة لتلك الحقيقية. أحاول استخدام البيانات الأكثر إزعاجًا لجمع أكبر عدد ممكن من المخاريط في مرحلة التخطيط. أتخذ أسماء غير مناسبة ، وأظهر كيف يتم فرض قيمة شريط التمرير على نص آخر.

قاعدة البيانات

المشروع مستضاف على صفحات جيثب . في البداية ، أردنا تحضير البيانات في جدول google ، ثم تحويلها إلى csv وإلزامها بجيثب. ونتيجة لذلك ، قررنا تحميل البيانات مباشرة من جدول Google.

مزايا هذا الحل:

• ستانيسلاف دروبيشيفسكي يمكنه تغيير البيانات دون مساعدتنا.
• في عملية التطوير ، كان من الضروري غالبًا تصحيح الأخطاء ، لتجربة ترتيب مختلف للبيانات. لقد وفر لنا جدول Google الكثير من الوقت.

السلبيات:

• يتم تحميله لفترة أطول قليلاً ، ولكن ليس حرجًا.
• إذا أفسدت البيانات في الجدول ، فسيتعطل الموقع أيضًا على الفور. ومع ذلك ، يحتفظ جدول Google بمحفوظات التغييرات ، في حالة وجود مشكلة يمكنك العودة إلى الإصدار القديم. يمكنك أيضًا تكرار ورقة العمل قبل إجراء التغييرات واستخدام النسخة المكررة كنسخة احتياطية.

نسخ البيانات

الصعوبة الرئيسية هي التعشيش العميق للأصناف. فيما يلي قائمة بجميع الرتب:

1. فرقة السلام
2. مفرزة
3. أمر فرعي
4. فرقة الأشعة تحت الحمراء
5. بارفوترياد
6. الفصيلة
7. العائلة
8. الفصيلة الفرعية
9. نوع

لتبسيط نسخ البيانات والتحقق منها ، قمت برسم زهر ملون فوق الدائرة. اللون يعني رتبة التاكسي ، يتم توقيع الأسماء في الأعلى.

النسخة الكاملة

جاءت ليليا كوليسنيكوفا للإنقاذ. يقوم بنسخ البيانات من PDF إلى جدول 300 صف. بالطبع ، أريد أتمتة العملية ، ولكن هذا صعب: بعض الفروق الدقيقة ليست واضحة حتى مع النقل اليدوي.

عمل فني

تساعد الصور على تنويع قماش رتيب وتساعد على تخيل ما يبدو عليه ممثلو التصنيف. ندعو في مشروع المصور. تاتيانا سيرجيفنا تبدأ العمل.

نناقش المراجع:

نختار الصور وإعادة بناء الممثلين النموذجيين ، وتلفت تانيا. تساعد بعض الرسوم التوضيحية الهندسية في تشتيت الانتباه عن التفاصيل التي تختلف اختلافًا كبيرًا من نوع إلى آخر.

التحقق من البيانات

عند النقل من PDF إلى البيانات ، تسللت الأخطاء. لذلك ، قبل عرض المخطط على ستانيسلاف ، نتحقق من أنفسنا.

1. يجب أن ترتبط كل دولة بإحدى القارات فقط. أتحقق من هذا الامتثال للوحة محورية:

.

1. لتسهيل التحقق من الفترات ، أكتب نصًا صغيرًا على d3 ، والذي يوقع بداية ونهاية الفترات مباشرة على الرسم البياني. كان من الضروري القيام بذلك منذ البداية.

1. في بعض الأحيان تتشابه أسماء الأصناف مع بعضها البعض ، ولكنها مختلفة في الواقع. لحماية نفسي من مثل هذه الأخطاء ، أقوم بإدراج صور التجزئة بجانب أعمدة التصنيف. إذا اختلفت كلمتان عن حرف واحد على الأقل ، فستختلف الصور على الأرجح وسيتم اكتشاف خطأ:

يتم تحميل الصور من http://avatars.adorable.io/

الصعوبات

أثناء العمل ، تظهر مشاكل مثيرة للاهتمام ، نناقشها مع ستانيسلاف.

على سبيل المثال ، بعض الأصناف تأتي من الأنواع اللاحقة. على سبيل المثال ، Amphipithecidae → Oligopithecinae → Perupithecus ucayaliensis. بالطبع ، هذا مستحيل ، لم يتم العثور على ممثلين سابقين عن Amphipithecidae و Oligopithecinae حتى الآن. قررنا زيادة التاكسي الأم بشكل مصطنع في الماضي:

في البداية ، اعتقدنا أن الاتصالات ممكنة فقط بين "الطوب" ، ولكن تبين بعد ذلك أننا بحاجة إلى القدرة على ربط أي أصناف: "الطوب" و "الإطارات". يتعين علينا إزالة الاتصالات التي تنطوي على مشاكل حتى الآن (من EOSIMIIFORMES للانفصال عن بعد)

في بعض الأحيان تأتي أشياء مثيرة للاهتمام:

للمستقبل

• تتمثل المهمة القصوى في إنشاء قاعدة من الاكتشافات الأثرية وإظهارها في هذا الرسم التخطيطي. الآن ليس من الواضح من أين جاءت كل هذه الخطوط ، وما هي الاكتشافات الأثرية وراءها.
• إضافة القدرة على التواصل بين الأصناف من أي رتبة. الآن يمكن توصيل الطوب فقط ببعضها البعض. لذلك ، لا يمكننا إظهار اتصال بالمخطط الأصلي EOSIMIIFORMES → Amphipithecidae
• عرض أماكن الاكتشافات الأثرية مباشرة على الخريطة.
• تغيرت الأرض بشكل كبير على مدى 65 مليون سنة. سيكون من الرائع تحريك المؤشر على المخطط الزمني لتغيير شكل خريطة الألوان أدناه.
• يمكنك جمع أسماء الأصناف بدقة على الجانب الأيسر ، كما هو الحال في الجدول في Tufty .
• عند النقر على التاكسون ، اعرض معلومات مفصلة عنه.
• ليس لدى علماء الأنثروبولوجيا وجهة نظر واحدة للتطور. أود أن أتصور عدم اليقين هذا في المستقبل وأن أرى ما يتفق عليه الجميع وما هي الآراء المختلفة.

→ موقع المشروع

ما رأيك تحولت بشكل جيد وما هو السيئ؟ كيف ستحسن المشروع؟

إذا كانت لديك بيانات مثيرة للاهتمام تحتاج إلى معالجتها وتصورها وعرضها على الأشخاص - اكتب ، يسعدنا التعاون: ivan@dianov.org ، والبرقيات:ivan_dianov