OhmyGut Phase One Ergebnisse
Atlas hat bereits über unser Forschungsprojekt OhmyGut-Darmbakterien gesprochen . Im Januar haben wir Crowdfunding auf Boomstarter gestartet, um mit der Erforschung der Mikrobiota der russischen Bevölkerung zu beginnen. Dies war der erste Fall in Russland auf der Suche nach öffentlichen Mitteln für ein biotechnologisches Projekt - und es erwies sich als erfolgreich.Nach Abschluss der Kampagne auf Boomstarter haben wir allen Teilnehmern zwei Sätze von OhmyGut-Tests geliefert. Die Idee war folgende: Jeder besteht die erste Analyse, geht dann den Fragebogen durch, erhält Ernährungsempfehlungen, folgt ihnen zwei Wochen lang und besteht den Test erneut. Als Ergebnis erhalten wir 271 x 2 Röhrchen und eine große Menge Material zum Testen von wissenschaftlichen und Marketing-Hypothesen.So ist alles passiert, und jetzt werden wir die Ergebnisse teilen.
Sie sagten mir ein Wort, ich verbreitete es in einer Reihe
Um festzustellen, welche mikrobiellen Arten und in welchen Anteilen im Darm leben, wird die metagenomische Sequenzierung verwendet. Diese Technologie liest die genomische Sequenz von Mikroben "wie sie ist", ohne sich zuerst in Gruppen und wachsende Kolonien in Petrischalen zu teilen.Wir haben die einfachste und billigste Methode angewendet: Wir haben nicht alle Genome vollständig gelesen, sondern nur ein Gen jeder Mikrobe mit einer Länge von mehreren hundert Buchstaben - nämlich 16S-rRNA. Die Zelle verwendet diese Sequenz, um das Ribosom zu konstruieren, die wichtigste molekulare Maschine, die für die Proteinsynthese erforderlich ist.Die 16S-rRNA-Gensequenz ist für jede Spezies einzigartig. Daher eignet es sich hervorragend zur Genotypisierung von Bakterien. Die Sequenz wird mit Sequenzern gelesen (die teuerste Ausrüstung im gesamten Prozess). Aus Mikrobiota-Proben extrahierte DNA wird dem Eingang zugeführt, und am Ausgang werden Daten erhalten: Tausende von Lesevorgängen für jede Probe. In unserer Studie wog der durchschnittliche Lesevorgang etwa 250 Buchstaben.So sieht die Lektüre des Escherichia coli Escherichia coli- Genoms aus : Die
Bestimmung der Art, Gattung oder Familie von Bakterien durch dieses Wort ist dank einer Reihe genomischer Untersuchungen von Bakterien möglich geworden. Alle Daten und wissenschaftlichen Veröffentlichungen werden in einer gemeinsamen öffentlichen NCBI-Datenbank zusammengefasst .Im Allgemeinen ähneln die Methoden zur Untersuchung der Bakterienzusammensetzung denen, die wir für den Gentest verwenden. Unter Laborbedingungen isolieren wir die DNA einer separaten Genomregion (16S-rRNA im Fall von Mikrobiota) unter Verwendung spezieller Primer, multiplizieren dann die erhaltenen Moleküle mit Hilfe eines Polymerase-Proteins, lesen sie ab, erhalten Ablesungen und bestimmen, welche Bakterien und in welchen Anteilen in der Probe vorhanden sind. Wir analysieren die erhaltenen Daten, erstellen einen Bericht und Empfehlungen basierend auf den Ergebnissen und laden sie auf Ihr persönliches Konto hoch. #all glücklich.In Russland bietet niemand sonst solche Studien einem breiten Spektrum von Anwendern an. In den USA wurde vor einigen Jahren das uBiome- Projekt gestartet , das Tests auf Mikrobiota (und nicht nur auf Darm) durchführt. Mein Mikroben- Forschungsprojekt arbeitet in DeutschlandBisher ist dies jedoch kein kommerzielles Produkt, und die Teilnahme daran kostet etwa 600 Euro. OhmyGut hat keine näheren Konkurrenten.Beispieldarstellung und -kontrolle
Crowdfunding war nicht nur ein Beta-Test von OhmyGut als zukünftiges kommerzielles Produkt , sondern auch eine wissenschaftliche Forschung. Trotzdem gab es keine Kontrollgruppe: Wir haben keine Hypothesen aufgestellt, um zu testen, welches Design für die „Experimentkontrolle“ erforderlich sein könnte.Die Stichprobe „Teilnehmer an Crowdfunding auf Boomstarter“ ist nicht repräsentativ - in dem Sinne, in dem dieses Konzept in der Epidemiologie verwendet wird. Für unsere Studie haben wir keine Moskauer ausgewählt, die Statistiken für Moskau widerspiegeln würden. Obwohl alle drei Hauptenterotypen in unserer Stichprobe vertreten waren, können wir nicht sagen, dass das Verhältnis dieser Typen in einer repräsentativen Stichprobe von Moskau oder Russland gleich sein wird. "Nicht repräsentativ" bedeutet jedoch nicht "unwissenschaftlich".Was ist sonst noch so ein Enterotyp?— , , .
Wir führten eine prospektive Interventionsstudie durch, bei der die Ernährungsempfehlungen, die wir den Teilnehmern nach dem Ausfüllen des Fragebogens gaben, Interventionen waren. Nach den Ergebnissen unserer Studie haben wir den Einfluss verschiedener Faktoren auf die Zusammensetzung der Mikrobiota sowie den Bereich der Veränderungen der Mikrobiota für diejenigen bewertet, die ihre Essgewohnheiten geändert haben und nicht geändert haben.Ein Beispiel für eine Studie mit einem ähnlichen Design ist das Projekt , bei dem zwei Gruppen getrennt betrachtet wurden: Vegetarier, die anfingen, Fleisch zu essen, und Fleischesser, die aufhörten, Fleisch zu essen und pflanzliche Lebensmittel zu essen.Wer sind Crowdfunding-Mitglieder von OhmyGut?
Insgesamt nahmen 271 Personen an der Studie teil, alle sind Einwohner Moskaus. Wenn wir den durchschnittlichen Teilnehmer am OhmyGut-Projekt beschreiben, handelt es sich um einen jungen Mann (29-31 Jahre) mit normalem Körperbau (Body Mass Index 21–23 mit einer Norm von 19–25), der viermal am Tag isst und 7–8 Stunden schläft. Er treibt mehrmals pro Woche Sport (und zieht Cardio-Belastungen dem Krafttraining vor) und trinkt nicht viel - nur mehrmals im Monat ein Glas trockenen Wein. Vielleicht erkennen wir uns oder unsere Freunde in diesem Porträt.Und was essen sie?
Die Ernährung eines durchschnittlichen OhmyGut-Testteilnehmers ist Standard: Fleisch-, Milch- und Sauermilchprodukte, Kartoffeln und Weißbrot mehrmals pro Woche und kein Leinsamenöl und Quinoa (bis wir unsere Empfehlungen erhalten). Mit einem Wort, nichts, was wir nicht über uns selbst wussten.Basierend auf den Ergebnissen des Fragebogens haben wir ein Diagramm erstellt und Verknüpfungen zwischen Produkten hergestellt, die Teil der normalen Ernährung unserer Teilnehmer sind. Es war interessant, das mathematische Modell mit Beobachtungen aus dem Leben zu testen. Die Studienteilnehmer essen Tomaten nur mit Gurken; Wenn die Ernährung Fleisch enthält, dh Geflügel, wird Zucchini mit Auberginen und Blumenkohl - mit Brokkoli - kombiniert. In der Grafik sehen Sie, wie die Produkte nach zwei Typen gruppiert sind: bedingt vegetarisch (obere rechte Ecke) und bedingt fleischfressend (unten links).
Was ist passiert?
Wir haben eine Datenbank mit Mikrobiota-Zusammensetzung und Benutzermetadaten sowie einen Bericht für Teilnehmer auf über 90 Seiten zusammengestellt. Es enthält mehrere Abschnitte: die Zusammensetzung der Bakterien, eine Beschreibung der Arten von Mikrobiota, das Schutzniveau gegen Krankheiten, die Vitaminogenese, die Synthese von Butyratbuttersäure, Empfehlungen für Produkte und Präbiotika.Dank unserer Empfehlungen konnten einige Teilnehmer die Repräsentation nützlicher Bakterien erhöhen, die Mikrobiota ausgeglichener machen und sogar eine Gruppe von Mikrobiota in eine andere umwandeln. Zum Beispiel vom dritten Typ mit einer vorherrschenden "westlichen" Ernährung und Fast Food - im zweiten eher vegetarisch.Der wichtigste Erfolg ist die Bestätigung, dass ein normaler gesunder Mensch bereit ist, einen solchen Test zu bestehen. Sogar zweimal. Nur um besser zu essen. Beeindruckend!Was hat nicht geklappt
Wir werden weiter am Abschnitt mit den Empfehlungen arbeiten. Jetzt stellen wir eine Liste zusätzlicher Produkte zur Verfügung, die gut für gute Bakterien sind und deren Repräsentation erhöhen. Es enthält zum Beispiel Endivien und Topinambur - und wir haben immer noch die Bananenblätter aus dem Text entfernt (Anmerkung an die Gastgeberin: Sie sind nützlich).Gleichzeitig ist es falsch, ausschließlich Kolonien von Darmbakterien zu erhalten und gleichzeitig den menschlichen Körper selbst ohne essentielle Nährstoffe zu verlassen. Wir haben diese Nuance berücksichtigt und planen, in der nächsten Iteration des Berichts auf die Grundlagen der richtigen Ernährung Bezug zu nehmen.Was jetzt?
Wir müssen uns nur bei allen Crowdfunding-Teilnehmern bedanken und wieder an die Arbeit gehen. Vor der zweiten Ausgabe des Berichts, korrigiert und ergänzt, der kommerzielle Start des Tests und die Integration mit den Daten des Gentests. In der Zwischenzeit können Sie Luft holen und Spaß haben .
Source: https://habr.com/ru/post/de395021/
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