🔀 👩‍🚒 👋🏾 Microbiota. Comment fonctionne le test? 🦐 👩‍👧 🤳🏽

Nous terminons une série d'articles sur le microbiote. Le premier concernait le fonctionnement du microbiote et le dernier , l'effet des médicaments sur les bactéries intestinales. Dans cet article, nous vous expliquerons comment le test «Microbiota Genetics» d'Atlas est mené, pourquoi il a besoin d'un échantillon de chaise et aussi ce que l'utilisateur recevra en fonction des résultats du test. Pour nos fidèles lecteurs, nous avons préparé un cadeau à la fin de l'article!

Illustration de Rentonorama

Clause de non-responsabilité! Le test "Génétique du microbiote" n'est pas diagnostique et est destiné aux adultes en bonne santé qui souhaitent en savoir plus sur l'état de leurs intestins. Si vous présentez des symptômes et êtes inquiet pour votre santé, consultez votre médecin.

Pourquoi merde

Le microbiote intestinal dans le monde est désormais isolé d'un échantillon de selles. C'est simple, sûr et bon marché. L'analyse du microbiote dans ce cas est exacte: on peut mesurer les parts des familles bactériennes et des genres. Cependant, l'image ne sera caractéristique que du côlon.

L'étude des bactéries de l'intestin grêle est difficile. Même pour le diagnostic de maladies, telles que le syndrome de prolifération bactérienne, des tests respiratoires non invasifs sont utilisés. Par conséquent, toutes les données sur le microbiote, en fait, sur les bactéries du gros intestin.

La boîte de collecte des biomatériaux contient un tube à essai, un revêtement pour les toilettes, une spatule, une balance Bristol et des instructions. Un revêtement spécial vous permet d'éviter le contact de l'échantillon avec les toilettes, ce qui rend l'analyse plus précise.

Différentes entreprises utilisent des superpositions différentes. Par exemple, le Human Microbiome Project donne aux utilisateurs des conteneurs en plastique dans lesquels l'échantillon est immédiatement emballé. Nous considérons la version papier comme plus écologique, sûre et économique.

Utilisez une spatule pour transférer environ un pois de matière dans un tube à essai. Après cela, vous devez le fermer et bien le secouer. À l'intérieur du tube à essai se trouve une solution - c'est un stabilisateur d'ADN qui empêche le matériel génétique des bactéries de se détériorer avant le laboratoire. Nous utilisons un conservateur bactéricide qui tue les bactéries mais laisse l'ADN entier.

Afin que les résultats du test soient plus précis, nous demandons à l'utilisateur d'évaluer son échantillon de selles sur l'échelle de Bristol. Il prend en compte la forme et la cohérence, ce qui affecte finalement le résultat. Des études montrent que plus l'échantillon est difficile, plus le microbiome humain est diversifié. Et les selles molles sont souvent associées à des bactéries rares.

Comment est le séquençage

Les fragments d'ADN qui appartiennent à un gène d'ARNr 16S spécifique sont isolés d'un échantillon de selles en laboratoire. RRNA est un ARN ribosomal, et nous étudions un gène contenant des informations à ce sujet.

Ce gène est l'un des principaux facteurs de classification des bactéries et des archées: par sa séquence, nous déterminons qui appartient à quel genre et à quelle famille, à quel point les bactéries sont proches les unes des autres.

Le gène de l'ARNr 16S est unique en ce qu'il combine des régions conservatrices et variables qui vous permettent de déterminer la généalogie des bactéries (taxonomie). Nous lisons la séquence nucléotidique de chacun de ces fragments et découvrons à quel genre et à quelle famille appartient la bactérie. Cela peut être comparé à la détermination de la région par le numéro de voiture. Plus il y a de fragments identiques d'ARNr 16S dans l'échantillon, plus la proportion de certaines bactéries auxquelles il appartient est élevée.

En conséquence, nous obtenons une composition en pourcentage avec une part pour chaque type de microbes. Et la fonction du microbiote dépend du nombre de types de micro-organismes. Par exemple, si vous avez de nombreuses bactéries qui produisent de l'acide butyrique, cela signifie que votre microbiote fait du bon travail.

Chaque profil de microbiote est comparé aux moyennes de population de la base, que nous avons collectées sur la base de travaux scientifiques et grâce aux participants à la campagne de crowdfunding. Nous analysons donc en quoi votre microbiote diffère de la composition des bactéries dans une population en bonne santé.

Que vais-je recevoir

Par la composition des bactéries intestinales, il est possible de déterminer comment le microbiote gère le traitement des fibres, la synthèse de l'acide butyrique, la production de vitamines, ainsi que la diversité et la similitude du microbiote des personnes atteintes de maladies.

Variété

Il s'agit du premier signe qu'un utilisateur de test est présenté. La diversité du microbiote détermine la stabilité de la communauté bactérienne et sa protection contre les micro-organismes pathogènes. Plus il y a de bactéries différentes qui vivent dans les intestins, meilleure est la sensation d'une personne et plus faible est le risque de développer une inflammation. Cela a été prouvé dans un certain nombre d'études.

Malheureusement, il est difficile de démarrer un nouveau type de micro-organisme qui n'est pas dans les résultats. Il arrive qu'en raison des recommandations, ces bactéries se développent qui sont initialement présentées en dessous de notre seuil (0,02%). Cependant, c'est plutôt l'exception.

Traitement des fibres et synthèse de l'acide butyrique

Nous avons déjà écrit que les fibres dans l'alimentation réduisent les risques de maladie et de mortalité quelle qu'en soit la cause. Cependant, si la proportion de bactéries qui traitent les fibres est faible, l'apport en fibres peut être moins efficace. Dans ce cas, nous dressons une liste de produits dont la consommation augmente la proportion de ces bactéries.

La synthèse de l'acide butyrique dépend de l'efficacité avec laquelle les micro-organismes traitent la fibre. Il nourrit les colonocytes - les cellules épithéliales intestinales. Lorsque cet acide n'est pas suffisant, les cellules font face à des micro-organismes pathogènes pires et les intestins sont plus sujets à l'inflammation.

Nous analysons le nombre de bactéries productrices d'acide butyrique dans le microbiote, et sur cette base, nous donnons une estimation. Si ces micro-organismes sont peu nombreux, une liste de produits recommandés pour améliorer la situation apparaîtra dans la section.

Bactéries probiotiques

Il est connu que certains types de bactéries apportent de grands avantages aux humains. Ils aident les cellules intestinales à réguler l'immunité, protègent contre l'obésité, produisent de l'acide butyrique et d'autres métabolites importants.

Nous analysons la proportion de ces micro-organismes et collectons des données dans un bloc séparé. Là, vous pouvez en savoir plus sur chaque bactérie probiotique, quelles fonctions elle remplit et combien elle fait habituellement dans une population en bonne santé.

Vous pouvez augmenter la proportion de ces bactéries si elles se trouvent dans le microbiote. Il suffit d'utiliser des produits laitiers fermentés avec des bactéries vivantes, de la choucroute, du kombucha (Kombucha), des produits avec les types de fibres sur lesquels ces micro-organismes se développent ou des additifs probiotiques spéciaux.

En ce qui concerne la prise de suppléments, il est préférable de consulter d'abord un spécialiste. Fait intéressant, les bactéries probiotiques sont bénéfiques, même si elles ne sont pas dans le microbiote humain et qu'elles traversent simplement le tractus gastro-intestinal.

Protection contre les maladies

Jusqu'à présent, mal compris comment les bactéries affectent le développement des maladies et comment elles interagissent avec les médicaments. Néanmoins, il existe des preuves que la composition des bactéries intestinales chez les personnes atteintes de maladies est très différente. Dans nos articles précédents, nous avons expliqué en détail ce que l'on sait à ce sujet en ce moment.

Dans l'étude, nous comparons votre microbiote avec le microbiote caractéristique d'une personne atteinte d'une maladie et évaluons la différence des profils. Si votre microbiote est complètement différent du microbiote du patient, vous avez de la chance, probablement, votre risque est plus faible. Et si les profils sont similaires, vous devez faire attention à la santé du corps et à l'état des bactéries intestinales.

Liste de toutes les maladies de votre compte

Des vitamines

La composition du microbiote détermine dans quelle mesure les bactéries produisent des vitamines. Fondamentalement, ils synthétisent les vitamines K et B. Cela peut affecter le niveau global de vitamines dans le corps. Le problème est que nous ne pouvons pas mesurer la façon dont les intestins absorbent ces nutriments. De plus, plus le microbiote synthétise de vitamines, plus il est probable qu'elles soient absorbées et soutiennent le niveau global normal d'oligo-éléments.

Entérotypes

Selon la famille et le genre de bactéries qui dominent dans le microbiote, tous les profils peuvent être conditionnellement divisés en trois types. Ils sont également appelés entérotypes.

Dans le microbiote des amateurs de régimes alimentaires occidentaux, les bactéries du genre Bacteroides prédominent souvent. Dans notre test, ce type est appelé «résident d'une grande ville». Ceux qui aiment les céréales et les féculents ont généralement une proportion plus élevée de la famille Firmicutes et d'acide butyrique producteur de bactéries. Nous appelons les représentants de ce type «Village paysan». Parmi les amateurs de légumes, de fruits et de sucreries, le genre Prevotella domine souvent. Habituellement, ce type est plus fréquent chez les peuples tribaux, donc dans notre test, il est appelé «habitant de la jungle».

Cela dépend de l'entérotype dans quelle mesure les bactéries gèrent le traitement des fibres, la synthèse de l'acide butyrique et des vitamines. Parfois, une personne peut avoir un type de microbiote mixte. Dans ce cas, les zones de projection des bactéries caractéristiques de chaque type sont superposées. Mais un entérotype dominera toujours (celui de la couche supérieure du graphique).

Recommandations nutritionnelles

Chaque signe a une échelle qui est divisée en trois couleurs: rouge, jaune et vert. Le vert signifie que tout va bien pour vous, le jaune est dans les limites normales et le rouge est un signal pour un changement de style de vie. Chaque article problématique a des listes de produits recommandés. La seule exception est le signe de la diversité, dont nous avons parlé plus haut.

Les listes de produits sont basées sur des bactéries intestinales. Nous analysons quelles bactéries dans le microbiote sont peu nombreuses, quel type de fibre elles aiment et aussi où ces fibres sont contenues. Il s'avère qu'une liste peut augmenter la proportion de bactéries nécessaires.

Analyser constamment différentes listes et choisir parmi elles des produits pour le panier d'épicerie - prend beaucoup de temps et d'attention. Par conséquent, nous avons créé un algorithme qui sélectionne plusieurs attributs par semaine, analyse les listes de produits recommandés et compile le TOP-10.

Il est affiché sur la page principale de notre application iOS et dans votre compte, votre tâche est d'inclure ces produits dans votre alimentation cette semaine. Ensuite, la liste sera mise à jour: elle aura d'autres fonctionnalités et produits.

Quoi alors

Le microbiote est constamment mis à jour en fonction de l'alimentation. Lorsque vous mangez plus de viande et de sucreries, les bactéries qui décomposent les fibres sont rares. Le microbiote fait face à des micro-organismes pathogènes pires, le risque d'inflammation augmente. Lorsque vous incluez beaucoup de légumes, de céréales et de fruits dans votre alimentation, la proportion de bactéries bénéfiques augmente. Par conséquent, le microbiote doit être surveillé en permanence.

Nous recommandons de répéter l'analyse du microbiote trois mois après le premier examen. Pendant ce temps, si vous suivez les recommandations, les changements seront plus importants et l'habitude d'inclure des produits de la liste dans l'alimentation aura le temps de prendre pied. Ainsi, vous pouvez suivre les changements liés à la nutrition et ajuster le régime alimentaire dans la bonne direction.

Le test "Génétique du microbiote" coûte 14 900 roubles, mais pour nos lecteurs sur Habré nous avons préparé une remise. Utilisez le code promo HABRBIOME et commandez un test pour 159 $. Livraison dans toute la Russie.

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