🐻 🏠 📫 Hasil OhmyGut Fase Satu 👨🏿‍⚕️ 🔄 🚁

Atlas telah berbicara tentang proyek penelitian bakteri usus OhmyGut kami. Pada bulan Januari, kami meluncurkan crowdfunding di Boomstarter untuk memulai penelitian tentang mikrobiota populasi Rusia. Ini adalah kasus pertama di Rusia dalam pencarian dana publik untuk proyek bioteknologi - dan ternyata berhasil.

Setelah menyelesaikan kampanye di Boomstarter , kami mengirimkan dua set tes OhmyGut kepada semua peserta. Idenya adalah ini: semua orang lulus analisis pertama, kemudian mereka pergi melalui kuesioner, mendapatkan rekomendasi nutrisi, mengikuti mereka selama dua minggu dan lulus tes lagi. Hasilnya, kami mendapatkan 271 x 2 tabung dan sejumlah besar bahan untuk menguji hipotesis ilmiah dan pemasaran.

Begitulah semuanya terjadi, dan sekarang kami akan membagikan hasilnya.

Mereka memberi tahu saya sepatah kata, saya sebariskan

Untuk menentukan spesies mikroba mana dan dalam proporsi apa yang hidup di usus, sekuensing metagenomik digunakan. Teknologi ini membaca urutan genom mikroba "sebagaimana adanya", tanpa terlebih dahulu membaginya menjadi kelompok-kelompok dan menumbuhkan koloni dalam cawan Petri.

Kami menggunakan metode paling sederhana dan termurah: kami tidak membaca semua genom secara keseluruhan, tetapi hanya satu gen dari setiap mikroba yang panjangnya ratusan huruf - yaitu, 16S rRNA. Sel menggunakan urutan ini untuk membangun ribosom, mesin molekuler paling penting yang diperlukan untuk sintesis protein.

Urutan gen 16S rRNA unik untuk setiap spesies. Karena itu, sangat bagus untuk bakteri genotyping. Urutan dibaca menggunakan sequencer (peralatan paling mahal di seluruh proses). DNA yang diekstraksi dari sampel mikrobiota diumpankan ke input, dan data diperoleh pada output: ribuan bacaan untuk setiap sampel. Dalam penelitian kami, rata-rata bacaan berbobot sekitar 250 huruf.

Inilah pembacaan genom Escherichia coli Escherichia coli :

Menentukan spesies, genus atau keluarga bakteri dengan kata ini menjadi mungkin berkat sejumlah studi genomik bakteri. Semua data dan publikasi ilmiah dikompilasi ke dalam database NCBI publik bersama .

Secara umum, metode untuk mempelajari komposisi bakteri mirip dengan yang kami gunakan untuk tes genetik. Di laboratorium, kami mengisolasi DNA dari wilayah genom tunggal (16S rRNA dalam kasus mikrobiota) menggunakan primer khusus, kemudian kami melipatgandakan molekul yang diperoleh dengan bantuan protein polimerase, membacanya, membaca, dan menentukan bakteri mana dan dalam proporsi apa yang ada dalam sampel. Kami menganalisis data yang diperoleh, menyusun laporan, dan rekomendasi berdasarkan hasil, mengunggahnya ke akun pribadi Anda. #semua bahagia.

Di Rusia, tidak ada orang lain yang menawarkan studi seperti itu untuk berbagai pengguna. Di AS, beberapa tahun yang lalu, proyek uBiome diluncurkan , yang melakukan tes mikrobiota (dan tidak hanya usus). Proyek Penelitian Mikroba Saya Bekerja di Jermantetapi sejauh ini ini bukan produk komersial, dan biaya partisipasi di dalamnya sekitar € 600. OhmyGut tidak memiliki pesaing yang dekat dengan mereka.

Representasi dan Kontrol Sampel

Crowdfunding bukan hanya uji beta dari OhmyGut sebagai produk komersial masa depan , tetapi juga penelitian ilmiah. Namun demikian, tidak ada kelompok kontrol di dalamnya: kami tidak mengajukan hipotesis apa pun untuk menguji desain "kontrol-eksperimen" yang mungkin diperlukan.

Sampel "peserta crowdfunding on Boomstarter" tidak representatif - dalam arti di mana konsep ini digunakan dalam epidemiologi. Untuk penelitian kami, kami tidak memilih Moskow yang akan mencerminkan statistik untuk Moskow. Meskipun ketiga enterotipe utama terwakili dalam sampel kami, kami tidak dapat mengatakan bahwa rasio jenis ini akan sama dalam sampel representatif Moskow atau Rusia. Tetapi "tidak representatif" tidak berarti "tidak ilmiah".

Apa lagi yang merupakan enterotype

— , , .

Kami melakukan studi intervensi prospektif, di mana rekomendasi nutrisi yang kami berikan kepada peserta setelah mengisi kuesioner adalah intervensi. Menurut hasil penelitian kami, kami mengevaluasi pengaruh berbagai faktor pada komposisi mikrobiota, serta kisaran perubahan mikrobiota bagi mereka yang telah berubah dan tidak mengubah kebiasaan makan mereka.

Contoh penelitian dengan desain serupa adalah proyek , yang mempertimbangkan dua kelompok secara terpisah: vegetarian yang mulai makan daging, dan pemakan daging yang berhenti makan daging dan makan makanan nabati.

Siapa anggota crowdfunding OhmyGut?

Secara total, 271 orang mengambil bagian dalam penelitian ini, semuanya adalah penduduk Moskow. Jika Anda menggambarkan rata-rata peserta dalam proyek OhmyGut, maka ini akan menjadi laki-laki muda (29-31 tahun) dari fisik normal (indeks massa tubuh 21-23 dengan norma 19-25), yang makan empat kali sehari dan tidur 7-8 jam. Dia melakukan olahraga beberapa kali seminggu (dan lebih suka latihan kardio daripada latihan kekuatan) dan tidak minum banyak - hanya segelas anggur kering beberapa kali sebulan. Mungkin kita mengenali diri kita atau teman kita dalam potret ini.

Dan apa yang mereka makan

Diet rata-rata peserta tes OhmyGut cukup standar: daging, produk susu dan susu asam, kentang dan roti putih beberapa kali seminggu dan tidak ada minyak biji rami dan quinoa (sampai kami menerima rekomendasi kami). Singkatnya, tidak ada yang tidak kita ketahui tentang diri kita sendiri.

Berdasarkan hasil kuesioner, kami menyusun grafik dan membangun tautan antara produk yang merupakan bagian dari diet normal peserta kami. Sangat menarik untuk menguji model matematika dengan pengamatan dari kehidupan. Peserta studi makan tomat hanya dengan mentimun; jika ada daging dalam makanan, yaitu unggas, zucchini dipasangkan dengan terong, dan bunga kol - dengan brokoli. Pada grafik, Anda dapat melihat bagaimana produk dikelompokkan dalam dua jenis: vegetarian bersyarat (sudut kanan atas) dan pemakan daging bersyarat (kiri bawah).

Apa yang terjadi

Kami telah menyusun database komposisi mikrobiota dan metadata pengguna dan laporan untuk peserta di lebih dari 90 halaman. Ini berisi beberapa bagian: komposisi bakteri, deskripsi jenis mikrobiota, tingkat perlindungan terhadap penyakit, vitaminogenesis, sintesis asam butirat butirat, rekomendasi untuk produk dan prebiotik.

Berkat rekomendasi kami, beberapa peserta dapat meningkatkan representasi bakteri menguntungkan, membuat mikrobiota lebih seimbang, dan bahkan mengubah satu kelompok mikrobiota ke yang lain. Misalnya, dari jenis ketiga dengan diet "Barat" yang dominan dan makanan cepat saji - yang kedua, lebih vegetarian.

Nah, keberhasilan yang paling penting adalah konfirmasi bahwa orang sehat biasa siap untuk lulus ujian semacam itu. Bahkan dua kali. Hanya untuk makan lebih baik. Mengesankan!

Apa yang tidak berhasil

Kami akan terus bekerja pada bagian rekomendasi. Sekarang kami menyediakan daftar produk tambahan yang baik untuk bakteri baik dan akan meningkatkan keterwakilan mereka. Termasuk, misalnya, artichoke endive dan Jerusalem - dan kami masih menghapus daun pisang raja dari teks (catatan untuk nyonya rumah: mereka berguna).

Pada saat yang sama, adalah keliru untuk mempertahankan koloni bakteri usus secara eksklusif dan pada saat yang sama meninggalkan tubuh manusia itu sendiri tanpa nutrisi penting. Kami memperhitungkan nuansa ini dan berencana untuk membuat referensi tentang dasar-dasar nutrisi yang tepat dalam iterasi laporan berikutnya.

Apa sekarang?

Kami hanya perlu mengucapkan terima kasih kepada semua peserta crowdfunding dan kembali bekerja. Menjelang laporan edisi kedua, dikoreksi dan ditambah, peluncuran uji komersial dan integrasi dengan data uji genetik. Sementara itu, Anda bisa bernafas lega dan bersenang-senang .

Hasil OhmyGut Fase Satu