⛹🏿 👩🏻‍🔬 👩🏻 Resultados OhmyGut Phase One 💅🏼 🎅🏼 🛐

A Atlas já falou sobre o nosso projeto de pesquisa de bactérias intestinais OhmyGut. Em janeiro, lançamos o crowdfunding no Boomstarter para iniciar pesquisas sobre a microbiota da população russa. Este foi o primeiro caso na Rússia em busca de financiamento público para um projeto biotecnológico - e acabou sendo bem-sucedido.

Após concluir a campanha no Boomstarter , entregamos dois conjuntos de testes OhmyGut a todos os participantes. A idéia era a seguinte: todos passam na primeira análise, depois passam pelo questionário, recebem recomendações nutricionais, seguem-nas por duas semanas e passam no teste novamente. Como resultado, obtemos 271 x 2 tubos e uma enorme quantidade de material para testar hipóteses científicas e de marketing.

Foi assim que tudo aconteceu e agora vamos compartilhar os resultados.

Eles me disseram uma palavra, eu espalhei em uma linha

Para determinar quais espécies microbianas e em que proporções vivem no intestino, é utilizado o seqüenciamento metagenômico. Essa tecnologia lê a sequência genômica dos micróbios "como está", sem primeiro se dividir em grupos e crescer colônias em placas de Petri.

Utilizamos o método mais simples e barato: não lemos todos os genomas na sua totalidade, mas apenas um gene de cada micróbio com várias centenas de letras - ou seja, 16S rRNA. A célula usa essa sequência para construir o ribossomo, a máquina molecular mais importante necessária para a síntese de proteínas.

A sequência do gene 16S rRNA é única para cada espécie. Portanto, é ótimo para genotipar bactérias. A sequência é lida usando sequenciadores (o equipamento mais caro em todo o processo). O DNA extraído das amostras de microbiota é alimentado na entrada e os dados são obtidos na saída: milhares de leituras para cada amostra. Em nosso estudo, a média de leitura pesava cerca de 250 letras.

É assim que se lê a leitura do genoma de Escherichia coli Escherichia coli : A

determinação da espécie, gênero ou família de bactérias por esta palavra tornou-se possível graças a vários estudos genômicos de bactérias. Todos os dados e publicações científicas são compilados em um banco de dados público conjunto do NCBI .

Em geral, os métodos para estudar a composição bacteriana são semelhantes aos que usamos para o teste genético. No laboratório, isolamos o DNA de uma única região do genoma (16S rRNA no caso da microbiota) usando iniciadores especiais, depois multiplicamos as moléculas obtidas com a ajuda de uma proteína polimerase, as lemos, obtemos leituras e determinamos quais bactérias e em que proporções estão presentes na amostra. Analisamos os dados obtidos, compilamos um relatório e recomendações com base nos resultados e os enviamos para sua conta pessoal. #tudo feliz.

Na Rússia, ninguém mais oferece esses estudos para uma ampla gama de usuários. Nos EUA, há alguns anos, foi lançado o projeto uBiome , que realiza testes de microbiota (e não apenas intestinal). Projeto de pesquisa My Microbes trabalha na Alemanhamas até agora este não é um produto comercial e sua participação custa cerca de 600 euros. OhmyGut não tem concorrentes mais próximos deles.

Representação e controle de amostras

O crowdfunding não foi apenas um teste beta do OhmyGut como um produto comercial futuro , mas também uma pesquisa científica. No entanto, não havia nenhum grupo de controle: não apresentamos hipóteses para testar qual o desenho do "experimento-controle" poderia ser necessário.

A amostra “participantes do crowdfunding no Boomstarter” não é representativa - no sentido em que esse conceito é usado em epidemiologia. Para o nosso estudo, não selecionamos esses moscovitas que refletissem estatísticas para Moscou. Embora todos os três principais enterótipos tenham sido representados em nossa amostra, não podemos dizer que a proporção desses tipos será a mesma em uma amostra representativa de Moscou ou Rússia. Mas "não representativo" não significa "não científico".

O que mais é esse enterótipo

— , , .

Realizamos um estudo prospectivo de intervenção, em que as recomendações nutricionais que demos aos participantes após o preenchimento do questionário foram intervenções. De acordo com os resultados de nosso estudo, avaliamos a influência de vários fatores na composição da microbiota, bem como a gama de alterações da microbiota para aqueles que mudaram e não mudaram seus hábitos alimentares.

Um exemplo de estudo com um desenho semelhante é o projeto , que considerou dois grupos separadamente: vegetarianos que começaram a comer carne e comedores de carne que pararam de comer carne e ingeriram alimentos vegetais.

Quem são os membros do crowdfunding OhmyGut?

No total, 271 pessoas participaram do estudo, todas residentes em Moscou. Se você descrever o participante médio do projeto OhmyGut, será um jovem (29-31 anos) de físico normal (índice de massa corporal 21-23 com uma norma de 19-25), que come quatro vezes por dia e dorme 7-8 horas. Ele pratica esportes várias vezes por semana (e prefere exercícios cardiovasculares ao treinamento de força) e não bebe muito - apenas um copo de vinho seco várias vezes por mês. Talvez reconheçamos a nós mesmos ou a nossos amigos nesse retrato.

E o que eles comem

A dieta do participante médio do teste OhmyGut é bastante padrão: carne, laticínios e produtos com leite azedo, batata e pão branco várias vezes por semana e sem óleo de linhaça e quinoa (até recebermos nossas recomendações). Em uma palavra, nada que não soubéssemos sobre nós mesmos.

Com base nos resultados do questionário, compilamos um gráfico e construímos links entre produtos que fazem parte da dieta normal de nossos participantes. Foi interessante testar o modelo matemático com observações da vida. Os participantes do estudo comem tomates apenas com pepinos; se houver carne na dieta, isto é, aves, abobrinha é acompanhada de berinjela e couve-flor - com brócolis. No gráfico, você pode ver como os produtos são agrupados de acordo com dois tipos: condicionalmente vegetariano (canto superior direito) e condicionalmente consumidor de carne (canto inferior esquerdo).

O que aconteceu

Compilamos um banco de dados de composição da microbiota e metadados do usuário e um relatório para participantes em mais de 90 páginas. Ele contém várias seções: composição das bactérias, descrição dos tipos de microbiota, nível de proteção contra doenças, vitaminaogênese, síntese de ácido butirato butírico, recomendações de produtos e prebióticos.

Graças às nossas recomendações, alguns participantes conseguiram aumentar a representação de bactérias benéficas, tornar a microbiota mais equilibrada e até mudar um cluster de microbiota para outro. Por exemplo, do terceiro tipo, com uma dieta "ocidental" predominante e fast food - no segundo, mais vegetariano.

Bem, o sucesso mais importante é a confirmação de que uma pessoa saudável comum está pronta para passar nesse teste. Mesmo duas vezes. Só para comer melhor. Impressionante!

O que não deu certo

Continuaremos a trabalhar na seção de recomendações. Agora, fornecemos uma lista de produtos adicionais que são bons para boas bactérias e aumentam sua representação. Inclui, por exemplo, endívia e alcachofra de Jerusalém - e ainda removemos as folhas de bananeira do texto (nota para a anfitriã: elas são úteis).

Ao mesmo tempo, é incorreto manter exclusivamente colônias de bactérias intestinais e, ao mesmo tempo, deixar o próprio corpo humano sem nutrientes essenciais. Levamos em conta essa nuance e planejamos fazer uma referência sobre os conceitos básicos de nutrição adequada na próxima iteração do relatório.

O que agora

Nós apenas temos que agradecer a todos os participantes do crowdfunding e voltar ao trabalho. Antes da segunda edição do relatório, corrigida e complementada, o lançamento comercial do teste e a integração com os dados do teste genético. Enquanto isso, você pode respirar e se divertir .

Resultados OhmyGut Phase One