OhmyGut第一阶段结果

Atlas 已经讨论了我们的OhmyGut肠道细菌研究项目。一月份,我们在Boomstarter上启动了众筹,开始研究俄罗斯人口的微生物群。这是俄罗斯为生物技术项目寻求公共资金的第一个案例-结果证明是成功的。

Boomstarter上完成活动之后,我们向所有参与者提供了两组OhmyGut测试。这个想法是这样的:每个人都通过了第一次分析,然后他们通过了问卷,获得了营养建议,跟随了他们两个星期,然后再次通过了测试。结果,我们得到了271 x 2根试管和大量材料,用于测试科学和市场营销假设。

事情就是这样,现在我们将分享结果。





他们告诉我一个字,我把它排成一行


为了确定肠道中哪些微生物种类和比例,使用宏基因组测序。该技术按原样读取微生物的基因组序列,而无需首先在培养皿中将其分成几类并在其中生长菌落。

我们使用了最简单,最便宜的方法:我们没有完整读取所有基因组,而是每个微生物只有数百个字母长的基因-16S rRNA。细胞利用该序列构建核糖体,核糖体是蛋白质合成所必需的最重要的分子机器。

每个物种的16S rRNA基因序列都是唯一的。因此,对细菌的基因分型非常有用。使用定序器(整个过程中最昂贵的设备)读取序列。从微生物群样品中提取的DNA被输入到输入中,并在输出中获得数据:每个样品有数千次读取。在我们的研究中,平均阅读量约为250个字母。

这就是大肠埃希氏菌基因组读物的样子



由于对细菌的许多基因组研究,用这个词确定细菌的种类,属或家族已成为可能。所有数据和科学出版物都被编入NCBI联合公共数据库

通常,研究细菌组成的方法与我们用于基因测试的方法相似。在实验室中,我们使用特殊的引物分离单个基因组区域的DNA(在微生物群的情况下为16S rRNA),然后在聚合酶蛋白质的帮助下将获得的分子繁殖,对其进行读取,读取并确定样品中存在哪些细菌以及以何种比例存在。我们分析获得的数据,根据结果编制报告和建议,并将其上传到您的个人帐户。 #都开心。

在俄罗斯,没有其他人可以向广泛的用户提供此类研究。几年前,在美国启动uBiome项目,该项目进行微生物群(不仅是肠道)的测试。我的微生物研究项目在德国工作但到目前为止,这还不是商业产品,参与该活动的费用约为600欧元。OhmyGut在他们附近没有竞争对手。

样本表示和控制


众筹不仅是OhmyGut作为未来商业产品的beta测试,还是一项科学研究。但是,其中没有对照组:我们没有提出任何假设来检验可能需要“实验控制”设计。

“在Boomstarter上进行众筹的参与者”样本没有代表性-从某种意义上说,这一概念在流行病学中得到了使用。在我们的研究中,我们没有选择能够反映莫斯科统计数据的莫斯科人。尽管在我们的样本中代表了所有三种主要肠型,但我们不能说在莫斯科或俄罗斯的代表性样本中这些类型的比例将是相同的。但是,“不具有代表性”并不意味着“不科学”。
还有什么是肠型
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我们进行了一项前瞻性干预研究,其中,我们在填写问卷后向参与者提供的营养建议是干预措施。根据我们的研究结果,我们评估了各种因素对微生物群组成的影响,以及那些改变了饮食习惯并没有改变饮食习惯的人的微生物群变化范围。

项目的一个类似设计的例子是该项目,该项目分别考虑了两个小组:开始吃肉的素食者和停止吃肉并吃植物性食物的食肉者。

OhmyGut众筹会员是谁?


共有271人参加了研究,他们都是莫斯科的居民。如果您描述OhmyGut项目的平均参与者,那么这将是一个身体正常(身体指数21–23,正常值为19–25)的年轻人(29-31岁),他每天进食四次,睡7至8个小时。他每周参加几次运动(并且喜欢有氧运动而不是力量训练),几乎不喝酒-每月只喝一杯干酒。也许我们在这张画像中认出了自己或我们的朋友。

他们吃什么


OhmyGut测试参与者的平均饮食非常标准:肉,乳制品和酸牛奶产品,土豆和白面包,每周几次,并且没有亚麻籽油和藜麦(直到我们收到建议)。一言以蔽之,我们对自己一无所知。

根据问卷调查的结果,我们编制了一张图表,并建立了属于我们参与者正常饮食的产品之间的链接。用生活中的观察来测试数学模型很有趣。研究参与者仅将番茄与黄瓜一起食用;如果饮食中有肉,那就是家禽,西葫芦与茄子搭配,而菜花与西兰花搭配。在图表上,您可以看到产品如何分为两种类型:有条件的素食(右上角)和有条件的肉食(左下)。



发生什么事了


我们已经建立了一个微生物群落组成和用户元数据的数据库,并为90多页的参与者提供了一份报告。它包括几个部分:细菌的组成,微生物群类型的描述,对疾病的防护水平,维生素生成,丁酸丁酸合成,产品和益生元的建议。







感谢我们的建议,一些参与者能够增加有益细菌的代表性,使微生物群更加平衡,甚至将一个微生物群变为另一个。例如,第三种以“西方”饮食和快餐为主,第二种是素食主义者。

好吧,最重要的成功是确认一个普通的健康人已经准备好通过这种测试。甚至两次。只是为了吃得更好。令人印象深刻!

什么没有解决


我们将继续处理建议部分。现在,我们提供了对有益细菌有益其他产品列表,并将增加它们的代表性。例如,它包括菊苣和菊芋-我们仍然从文本中删除了车前草的叶子(对女主人的提示:它们很有用)。

同时,仅保持肠道细菌的集落并同时使人体自身缺乏必需的营养物质是不正确的。我们考虑到了这一细微差别,并计划在下一次报告迭代中提供有关适当营养基础的参考。

现在呢


我们只需要感谢所有的众筹参与者并重新开始工作。在报告的第二版(已更正和补充)发布之前,该测试已商业化发布并与基因测试数据集成。同时,您可以喘口气,玩得开心

Source: https://habr.com/ru/post/zh-CN395021/


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