灵长类树可视化

斯坦尼斯拉夫·德罗比雪夫斯基（Stanislav Drobyshevsky）在今年年初发表了详细的灵长类动物起源树 。 PDF版本

Vkontakte的评论者要求使用交互式版本（ 1，2，3，4 ），因为它更易于学习，并且在出现新数据时更易于更新。

我和Olya Mokhova决定帮助古灵长类动物，并在d3js上制作了原型。

左边是原始图，右边是我们的版本：

项目现场

我将告诉您这项工作进展顺利，哪些技术对我们有所帮助。

目的

首先，我们要制定一个流行的科学计划，这是著名图片的更高级版本：

但是关于这个问题，格莱布•克劳利什（Gleb Krauklish ）已经有了一个出色的项目 。

我们决定采取另一种方式：建立一个用于考古数据汇总的原型系统。 当然，我想用构造板块的运动，发现的照片，每个分类单元的详细信息，Wikipedia的链接以及年平均温度图表制作一个大型项目。 但是我们决定从制作现有方案的交互式版本开始。

设计方案

在原始电路中，几乎从未使用过颜色。 例如，您可以用颜色显示在哪个大陆上找到了野兽。

我还想更清楚地显示分类单元（生物群）的层次结构。

我做第一个草图：

问题马上出现。 例如：“家庭关系应该以某种方式取决于分类单元的嵌套吗？” 我们必须深入研究维基百科，了解分类法和一夫一妻制 。 我从斯坦尼斯拉夫（Stanislav）了解到，该图上没有分类，这意味着家族关系树不必与分类单元的嵌套重合。

我用类似于真实数据的数据画了一个电路。 我尝试在布局阶段使用最不方便的数据来收集尽可能多的圆锥体。 我使用了不合适的名称，说明了滑块的值如何叠加在另一个文本上。

资料库

该项目托管在Github页面上 。 最初，我们想在google表中准备数据，然后将其转换为csv并将其提交到github。 结果，我们决定直接从Google表加载数据。

该解决方案的优势：

• Stanislav Drobyshevsky可以在没有我们帮助的情况下更改数据。
• 在开发过程中，经常需要纠正错误，以尝试不同顺序的数据。 Google表格为我们节省了很多时间。

缺点：

• 它的加载时间更长一些，但并不重要。
• 如果破坏表中的数据，该站点也会立即崩溃。 但是，Google表保留更改的历史记录，如果出现问题，您可以回滚到旧版本。 您也可以在进行更改之前复制工作表并将其用作备份。

复制资料

主要困难是分类单元的深层嵌套。 这是所有等级的列表：

1. 和平队
2. 支队
3. 子订单
4. 红外线小队
5. Parvotryad
6. 超家族
7. 家庭
8. 亚科
9. 种类

为了简化数据的复制和验证，我在电路顶部涂了彩色骰子。 颜色表示分类单元的等级，名称在顶部签名。

完整版

Lelya Kolesnikova进行了营救。 它将数据从PDF复制到300行表中。 当然，我想使过程自动化，但这很困难：即使手动传输，某些细微差别也不明显。

艺术品

图片有助于使单调的画布多样化，并有助于粗略想象分类单元代表的外观。 我们称为illustrator项目。 Tatyana Sergeevna开始做生意。

我们讨论参考：

我们选择照片和典型代表的重建，Tanya绘制。 一些几何插图有助于分散细节，每个物种的细节差异很大。

资料验证

从PDF传输到数据时，错误逐渐蔓延。 因此，在向斯坦尼斯拉夫展示该方案之前，我们先进行检查。

1. 每个国家应只涉及一个大洲。 我用枢轴板检查是否符合要求：

。

1. 为了使检查周期更容易，我在d3上编写了一个小脚本，该脚本在图表上直接标记了周期的开始和结束。 从一开始就必须这样做。

1. 有时，分类单元的名称彼此相似，但实际上有所不同。 为了保护自己免受此类错误的影响，我在分类单元列旁边插入了哈希图片。 如果两个单词至少相差一个字母，则图片很可能会有所不同，并且将检测到错误：

图片是从http://avatars.adorable.io/加载的

难点

在工作过程中，出现有趣的问题，我们与斯坦尼斯拉夫讨论。

例如，某些分类单元来自后来的分类单元。 例如，两栖类→寡皮科→秘鲁古猿。 当然，这是不可能的，只是尚未发现两栖类和寡皮科的较早代表。 我们决定在过去人为地增加父分类单元：

最初，我们认为仅在“砖”之间可以建立连接，但后来证明我们需要能够连接任何分类单元的功能：“砖”和“框架”。 到目前为止，我们必须删除有问题的连接（从红外分离EOSIMIIFORMES）

有时会出现一些有趣的事情：

为了未来

• 最大的任务是作为考古发现的基础，并在此图上显示它们。 现在还不清楚所有这些条纹来自何处，其背后是什么考古发现。
• 增加了在任何等级的分类单元之间进行通信的能力。 现在，只有积木可以相互连接。 因此，我们无法显示与原始方案EOSIMIIFORMES→Amphipithecidae的联系
• 在地图上直接显示考古发现的地点。
• 6500万年来，地球发生了巨大变化。 在时间轴上移动光标以更改下面的颜色图的形状会很酷。
• 您可以在左边整齐地收集分类单元的名称， 如Tufty的表所示 。
• 单击分类单元时，显示有关它的详细信息。
• 人类学家没有单一的进化观。 我想将未来的不确定性形象化，并看到每个人都同意什么，以及不同意见。

→ 项目现场

您认为结果如何，坏处是什么？ 您将如何改善项目？

如果您有需要处理，可视化和显示给人们的有趣数据-写，我们将很高兴与您合作：ivan@dianov.org，电报：@ivan_dianov