生物学家对衰老突变理论的看法

你好

应读者的要求,我发现有能力撰写本文的续篇。 第一篇文章主要旨在证实自然死亡的存在和重要性,以及“错误累积”理论中某些规定的毫无根据。 也许我会以同样的方式继续本文,但这一次对寻找永生不老药的方法略有偏见-毕竟,他们都对此感兴趣。

可以说,在第一篇文章中,我们从生物组织的最高点研究了自然死亡现象。 从这一层面上,人们可以清楚地看到什么进化可以“赶上”并开始为一种或另一种建立生活水平。 从创造永生长生不老药的角度来看,这个水平对我们来说完全没有意义,因为我们希望将特定的个体带入永生,众所周知,具体的个体不会在生物学意义上进化。 我们对执行句子的机制以及如何打破这种机制感兴趣。 因此,在本文中,我们将从“较低”的角度考虑问题-个人和细胞分子(我将尽力使这一点变得清晰,而不会用愤怒的生化性辱骂语)。

大多数现代不朽商人试图证明,在生命的过程中,身体处于外部或内部环境中,这导致许多点(或位点)突变,由于某种原因,新陈代谢正在兜售。 造成“扩散”的每个原因都不尽相同,但总的来说,在大多数情况下,归结为随着时间的推移“有害物质”的积累,并且,根据撰写本文的日期,时尚和个人喜好,它可能是氧化剂,自由基,“变质”的蛋白质等等。

一切似乎都是合乎逻辑的,但这是一种由半知识组成的幻觉。 首先,让我们弄清楚什么是突变及其导致的原因。 经典的“学校”定义告诉我们,突变是随机改变DNA的过程。 实际上,对于这个定义的总体发展而言已经足够了,但是我们陷入了困境,我们不得不更深入地研究。 在我冗长的解释之前,让我写一个更正确但同样​​简短的定义:突变是“随机” DNA变化的过程。 好吧,现在我们将简短记录的括号中打开。

变异率


好吧,首先,我们注意到突变的频率不高,难以置信的低,并且针对不同物种的个体。 通常,在评估突变的速度时(我将只显示顺序的第一位数扔掉),它们表示在碱基上有10 -6-10 -10个突变,如此之大的扩散仅仅是由于物种特异性所致。 另一方面,DNA中的核苷酸本身大约在10 4 (病毒)到10 9 (弦)之间,我们还考虑了细胞数量-例如,一个人中大约有10 14个细胞,所以不要给每个人都带来突变的幻想,尽管它们并不是很多人都认为。

然后魔术开始了,著名动画片乌格威大师讲了这么喜欢谈论的熊猫:随机性不是偶然的。 为了节省空间和时间,让我们立即丢弃那些我们不感兴趣的突变部分-产生性突变(并不是它们在质量上有显着不同,但是在那里会发生其他魔术,这些突变仅影响后代),我们对体细胞突变感兴趣-会立即影响我们。

因此,DNA中有保守位点(有些生物学家还从这些位点中选择了超保守位点),也就是说,这些是DNA不会突变的部分,仅此而已。 不,纯粹从理论上讲,它们可以变异,某些遗传学家可以专门“破坏”它们,但这并不能否定这些基因在大型系统发生(进化)分支中几乎相同的事实。 您要问多少(?),足够大,我会回答。 例如,您的这些区域以及鸡,鱼,青蛙或海龟几乎都是相同的(甚至鸡皮on都知道它的凉爽和令人难以置信),也就是说,分支是chordate(脊椎动物),这就是我们过去所说的“动物”)。 肯定在昆虫甚至所有节肢动物中立即发现或将要发现相同的区域(通常已经很清楚地在哪里,什么以及如何寻找)-我只是不知道。 (我认为现在每个有逻辑并相信错误累积理论正确的人都应该问自己:“好吧,如果死亡是邪恶的,而进化能够保护DNA的一部分,那么是什么阻止了它保护所有DNA呢?”)

我分心了,回到了我们的变异。 DNA片段的保护是否比平时更多,反之亦然? 当然有!

在这里,我陷入混乱!
事实是,我想用数字的顺序和分散性再次打动您,但我本人不记得这些数字,因为我没有尝试过。 当然,我已经上网了,但是一个半小时的谷歌搜索并没有带来任何结果。

让我这样做:我将在可以输入真实值的范围内编写这样的值。 而且,如果(我希望“何时”)你们中的一个人挖掘或记住了真实数字,并且我将在评论中看到它们,那么我将立即更正该文章。 (警告!您可以找到有关生成突变的资料,并且如上所述,那里的数字令人震惊,但与我们的主题没有直接关系)

有些地区的DNA诱变增加。 它们有时被称为“热点/基因座”。 为了理解这些要点的重要性,我将告诉您所有突变中大约20-30%发生在这些区域中,而这些区域本身占据了整个DNA长度的10%(请注意!作弊数-阅读上面的破坏者!)。 而且有一个称为“高变”的过程,因此,在您的DNA的较小基因座上(我没有找到数字,但绝对小于1%),一周内发生的突变比前一生的整个身体要多。 启发?

我想告诉您这些“事故”的作用机理,但是,首先,这个主题非常广泛,不仅仅涉及一篇文章,其次,我本人也是在研究这个主题,我不想误导您,第三,我们来看一些东西。
为了更全面地理解,让我们看一下无错误和多错误DNA部分的功能。

让我们从保守的站点开始,即使对于生物学家来说,它也更容易理解。 注意到许多保守基因具有多功能性(我们认为这将是多效性),也就是说,它们的工作是在各种不同的条件下开始的,例如,当您长大,甚至是冷的时候以及当您脱发时(用“您”之后的任何单词代替, “何时”,“何时”)。

同样,大多数保守位点都编码各种调节蛋白,进而“编码”(开始表达)调节蛋白的一部分(并且可能会有很多重复,以至于生物学家不得不发明一个新词组-调节级联(实际上这些级联通常会导致多功能性)),而所有这些经济活动都始于早期的本体生成(从受精卵到类人动物的成熟过程)。 更准确地说,当您的球胚开始形成人体的基本解剖结构时。 还记得海克尔吗? 好吧,他还为我们的生物学教科书提供了图纸,这些教科书上有一排排胚胎。 就是这个!

嘘! 嘘! 拿走火炬和干草叉...
我直接感觉到求真者如何紧张,脸红的冲动如何发生。 生物学家,提这个骗子!
恩,Haeckel有点儿狡猾,但是有件事,他伪造了一些图纸,显然他确实真的希望每个人都相信他的理论。 一切都变了! 但是,最有趣的事情不是,而是海克尔做出了正确的观察。 真相混淆了因果,但这对于一个不熟悉遗传学甚至达尔文著作的人来说是一个可以原谅的错误。 他认为,每个有机体都应通过其自身的发育,即其祖先所通过的形式。 (听起来就像是在断齿):本体发育是由系统发育决定的。 但实际上,事实证明控制胚胎,鸡,人的胚胎发育的“程序代码”部分取自早期的alpha版本,几乎没有修补。
海克尔受到了惩罚-他几乎被人遗忘了。 海克尔定律发生了变化,变成了“发展的沙漏”模型。 关于这个话题有一篇很棒的文章 ,尽管没有关于突变的字眼,但它的阅读将有助于更好地理解我在这里提出的内容。

我希望从描述中可以明显看出,那些对人体至关重要的基因变得保守起来,它们的保护通常是合乎逻辑的,并且可以表明其自身。

让我们进入诱变程度高的DNA区域。 好吧,让我们继续前进,以所需的视角窥视表面。 我要说的第一件事是,显然,这些区域与信息环境几乎没有联系(例如,与保守位点相比),并且很大程度上由基因组的“地形”决定。 热点的重要部分是未编码的DNA,部分存在大量重复(基元),在链或基因末端附近的突变频率也更高(此外,在同一末端的5'或3'存在相同的区别),并且同样,从该区域位于染色体上的位置开始,点突变出现在已经发生的点突变旁边的频率更高。 现在让我们详细介绍一下(我们将返回到我们的突变),现在我们有一个非常有趣的部分-超突变!

高变异的过程是开放的,并以脊椎动物免疫系统的工作为例进行了最佳研究。 我不会偏离经典,并且会在同一示例中告诉您所有内容。 请记住,在第一部分中,我曾写道生物系统是为了自己的利益而使用混乱,而不是与混乱作斗争(或类似的事情),因此这是最引人注目的例子之一。

当您的免疫系统不熟悉(或遗忘)的抗原进入您的身体时,超突变就会开始。 例如,您的B淋巴细胞未知的流感病毒(翻译:对流感病毒株具有低亲和力的B淋巴细胞)。 从这一刻起,在您的淋巴结中,就在生殖中心(是的,您只有一个),我们启动了一个真正的进化实验室! 通常,B淋巴细胞可以自行分裂,但在繁殖的中心,它们以工业规模生产(也可以自行生产,但速度很快)。 当接收到淋巴细胞无效的信号时,抗原样本将被递送至生殖中心(碰巧样本已包含在记忆细胞(T细胞)中)并“附着”于T细胞。 B淋巴细胞本身开始强烈突变,某些严格特异性的DNA片段负责抗体。 他们在特殊的诱变复合物-突变体的控制下进行此操作。 B淋巴细胞在表面和形式上均具有截然不同的抗体,因此它试图将其所有的抗体触角,触角,钩子等拾取到T细胞上的样品中。 捡起-做得好,这是一份对您具有高度亲和力的文凭,请到身体外部去感染病毒。 没有被拾起-傻瓜,你的死亡和遗忘。 下一个!

通常,抗原的进化选择需要5到10天(您有多少流感?)。 免疫应答中突变的频率为10 -3-10 -4 (回到上面的数字,查看顺序的差异),但这是所有DNA的基数。 如果我们考虑一个特定的基因(或者更好的是一个特定的基因座),那么该突变的发生率是100%(好吧,让您确定不会欺骗您的是95%)。

类似的中间结果。

  1. 显然,生物系统能够将自身的诱变控制到一个或另一个程度。
  2. 在基因组中,突变不是均匀分布的。
  3. 生物系统可以触发和控制进化过程。

第一段并不赞成错误累积理论,但并不禁止它。 第二个-给这个理论一个机会。 但是,为了决定是否实现这种机会,有必要了解突变如何“消灭”到表型中-也就是说,它们会影响我们。 这就是我们下一步要做的。

基因表达


问题在于大多数人认为蛋白质合成如下:n_Codon DNA> n_Codon RNA> n_氨基酸=蛋白质。 大概:

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但这又是不完全的信息,这就是为什么似乎任何突变(替换密码子中的“字母”)都会导致蛋白质发生变化的原因。 但是实际上,一切都有些复杂。 让我们追踪一下我们的突变。 在这里,某些突变落在非编码位点上,有些发生了中性突变(例如,替换密码子中的最后一个碱基≈85%不会导致氨基酸置换),我们立即丢弃了这些突变。

不相信密码子中的最后一个字母几乎没有任何意义吗? 检查一下自己:
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但是在这里,我们在一个基因上甚至在一个准备表达的位点上都有一个突变(是的,是的,在永远不会出现基因表达的地方会发生突变)。 再次分叉。 (我想在这里详细描述基因的排列方式,以及在某种情况下突变会发生什么,但是,对于所有这些内含子,终止子和其他外显子来说,让我们动手吧)。 一个基因不仅是一个分解成三重态(密码子)的序列,编码一个氨基酸链,而且还位于直接位于“编码”附近且距离不超过100-200个碱基的各种调控区域,主要的调控区域是起始和终止(启动子和终止子) (不要与起始和终止密码子混淆)。 根据发生突变的位置,我们可以获得以下结果:

如果在启动前启动子(启动子)或调节子被破坏,则基因可能会失去活性,蛋白质将无法合成。

调节位点的这种突变(例如动机)是可能的,其中合成将加速或减慢。

但是我们的突变可能恰好发生在基因的编码部分。

现在是时候了解为什么上面的图片不好了,图片中有什么问题吗? 主要是缺乏演员。 事实是,合成的每个阶段都由许多蛋白质和/或RNA-蛋白质复合物控制。 合成不是靠自己开始的,首先是某些蛋白质需要旋转染色质,而另一些蛋白质必须自己在双DNA上找到一个“着陆位点”(起始(转录的第一阶段)),这里的一切都不容易,例如,一个人可以首先着陆在DNA上一种蛋白质复合物,可增加DNA与下一个复合物的亲和力,这又是最终加入RNA聚合酶(另一种RNA蛋白复合物)所必需的,后者会触发信使RNA的转录。 我在互联网上找到此图:

图片

因此,我们得到了mRNA(mRNA),是时候获得蛋白质了。 但这稍后-我们仍然没有收到mRNA,我们将再介绍几个字符。 转录后,我们得到了mRNA的前体,然后它应该成熟(在我受教育的那几年中,它被称为一个更时尚,更成熟的名称-RNA处理(或RNA的转录后修饰甚至更差)),其中包括:

  • 封盖保护RNA免受不合理的降解,还提供运输(例如,通过细胞核膜),并参与以下三个词;
  • 剪接(剔除多余的密码子);
  • 编辑,但该蛋白质可能并不完全对应于编码该蛋白质的DNA密码子(并不总是存在);
  • 甲基化(并不总是存在)。

为了不重复进行相同的解释,我只注意到成熟的每个阶段都是由其自身的蛋白质和/或RNA蛋白质复合物提供的。 为了详细描述RNA成熟,需要比我的两篇文章都大的体积。 但是我们必须为我们提供其他重要知识。 如果基因中发生了突变,这并不意味着蛋白质必定会发生变化(再次是)。 错误的前mRNA根本不会通过成熟而被破坏。 当然,这里最关键的时刻是剪接和编辑,在两种情况下,提供成熟的蛋白质复合物都是“检查员”,错误的核苷酸序列使它们无法发挥作用(当然,这种情况并不总是会发生)。 进行这项工作本身时,会纠正一些错误,从而使蛋白质表型恢复正常。

在此处需要适当注意的是,同一RNA的剪接过程可能导致不同的结果,也就是说,在DNA上,您具有一个序列,一次编码多个蛋白质。 剪接的另一个有趣特征是,成熟的RNA可以由不同的pre-RNA组成。 好吧,您了解我的意思吗?

但这还不是全部。 我们已经在观察蛋白质如何从沿着RNA爬行的核糖体中爬行出来。 同样,在合成过程中,蛋白质也位于蛋白质上并驱动蛋白质,而主要的RNA-蛋白质复合物就是我们的核糖体。 值得注意的是,在分子机制的这一部分,没有一种或两种方法可以使mRNA沉默并停止产生蛋白质。 有些方法是基于反馈的-产生这种类型的蛋白质越多,您生产的蛋白质就越少,直到完全停止(此外,有时此过程是由产生的蛋白质本身启动的,几乎没有中介)。

谢天谢地,我们已经获得了突变蛋白。 , . : ( ).

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结论


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但是,以我的辩护,我可以说我们涵盖了最广泛的主题之一,尽管很流畅,但是没有细节。 我希望这很有趣。

Source: https://habr.com/ru/post/zh-CN441784/


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